MUSEUM ZOOLOGY, Jl. Ir. H. Juanda No. 3
Museum ini didirikan pada tahun 1894 oleh Dr. J. G. Koningsberger dengan nama Landbouw Zoologish Laboratorium, kini di bawah Balitbang Zoologi.
Koleksi yang ada di dalam museum ini meliputi ribuan bahkan puluhan ribu spesies binatang mamalia, serangga, Reptilia, Burung, Ikan, dan Moluska. Museum ini berdekatan dengan Kebun Raya Bogor, dan dibuka setiap jam 08.00 WIB sampai dengan jam 16.00 WIB.
Museum Zoologi
Museum Ethnobotani, Jl. Ir. H. Juanda No. 22-24Lembaga ini diresmikan oleh Menteri Riset dan Teknologi, BJ. Habibie pada tanggal 18 Mei 1989. Museum Ethabotani Indonesia menyimpan hal-hal yang berkaitan dengan tanaman-tanaman atau daun-daunan. Ada juga buah dari tanaman yang bisa dimakan atau diolah menjadi obat-obatan tradisional (jamu ataupun peralatan rumah tangga). Museum ini memperagakan mengenai tanaman dan pengolahan daunan disajikan melalui diorama yang indah.Koleksi lain adalah kurang lebih dari 1300 jenis koleksi artifact (benda-benda purbakala), mulai dari Aceh hingga Irian Jaya.Di museum ini terdapat pula daun-daun yang telah diawetkan.
Museum Perjuangan, Jl. Merdeka - Bogor
Museum Perjuangan Bogor didirikan tahun 1957, menyimpan bermacam-macam benda-benda dari senapan yang dipergunakan oleh pejuang, maupun senapan rampasan dari Jepang dan Inggris serta dilengkapi dengan diorama yang menggambarkan pertemuan di daerah Bogor dan sekitarnya.
Museum ini dibuka untuk umum dari jam 08.00 sampai jam 14.00 WIB, museum ini sangat mudah dijangkau dengan kendaraan umum.
Museum Tanah, Jl. Ir H. Juanda 98
Museum Tanah yang terletak di jalan Ir. H. Juanda berhadapan dengan Kebun Raya Bogor menyimpan koleksi tanah dan batu-batuan di Indonesia. Museum ini berada di gedung Pusat Penelitian Tanah, dibuka setiap hari hanya pada jam kerja dan dibuka untuk umum.